L’Autorité de régulation des activités ferroviaires (Araf) a tenu, le 22 avril 2015, une audience de conciliation dans le cadre du règlement du différend entre la région Pays de la Loire et Gares & Connexions. Tout comme le Stif, celle-ci juge les redevances des gares trop élevées. Les échanges entre la SNCF, la région et le régulateur ont fourni une nouvelle preuve d’un système ferroviaire sous tension.